Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ddx20Q9JJY4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ddx20Q9JJY4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ddx20Q9JJY4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx20Q9JJY4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms