Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cog8Q9JJA2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog8Q9JJA2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog8Q9JJA2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms