Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc86Q9JJ89 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc86Q9JJ89 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc86Q9JJ89 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc86Q9JJ89 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms