Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna1fQ9JIS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacna1fQ9JIS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cacna1fQ9JIS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms