Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r3fQ9JIG4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms