Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcirg1Q9JHF5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcirg1Q9JHF5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms