Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tm9sf3Q9ET30 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf3Q9ET30 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf3Q9ET30 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms