Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hapln2Q9ESM3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hapln2Q9ESM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hapln2Q9ESM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms