Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp29Q9ES63 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp29Q9ES63 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp29Q9ES63 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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