Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
V1ra8Q9EQ48 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
V1ra8Q9EQ48 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
V1ra8Q9EQ48 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms