Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsc1Q9EP53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc1Q9EP53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc1Q9EP53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms