Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aph1cQ9DCZ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aph1cQ9DCZ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Aph1cQ9DCZ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aph1cQ9DCZ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aph1cQ9DCZ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms