Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnk1dQ9DC28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk1dQ9DC28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms