Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syvn1Q9DBY1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syvn1Q9DBY1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syvn1Q9DBY1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms