Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Riok3Q9DBU3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Riok3Q9DBU3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms