Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Swt1Q9DBQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Swt1Q9DBQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Swt1Q9DBQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Swt1Q9DBQ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms