Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SelenooQ9DBC0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SelenooQ9DBC0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SelenooQ9DBC0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SelenooQ9DBC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms