Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB60

Fam213b, Prostamide/prostaglandin F synthase, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam213bQ9DB60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam213bQ9DB60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam213bQ9DB60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam213bQ9DB60 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms