Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf580Q9DB38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Znf580Q9DB38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf580Q9DB38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf580Q9DB38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf580Q9DB38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf580Q9DB38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms