Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pop5Q9DB28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop5Q9DB28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms