Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
3110070M22RikQ9DAQ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms