Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2bQ9DAC0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm2bQ9DAC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms