Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbc1d20Q9D9I4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tbc1d20Q9D9I4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d20Q9D9I4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms