Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2af1Q9D883 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2af1Q9D883 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2af1Q9D883 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms