Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca1Q9D7Z6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clca1Q9D7Z6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clca1Q9D7Z6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms