Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn22Q9D7U6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn22Q9D7U6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn22Q9D7U6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn22Q9D7U6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn22Q9D7U6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn22Q9D7U6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn22Q9D7U6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms