Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpap3Q9D706 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap3Q9D706 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpap3Q9D706 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpap3Q9D706 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms