Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc9bQ9D6E4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc9bQ9D6E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc9bQ9D6E4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms