Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn11Q9D572 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn11Q9D572 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn11Q9D572 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms