Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3a3Q9D554 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3a3Q9D554 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3a3Q9D554 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms