Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc83Q9D4V3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc83Q9D4V3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc83Q9D4V3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc83Q9D4V3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms