Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms