Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam90a1bQ9D4F3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam90a1bQ9D4F3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam90a1bQ9D4F3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms