Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sohlh2Q9D489 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sohlh2Q9D489 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sohlh2Q9D489 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sohlh2Q9D489 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms