Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933425L06RikQ9D3Z8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms