Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms