Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy3Q9D394 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rufy3Q9D394 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms