Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rasgef1cQ9D300 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rasgef1cQ9D300 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasgef1cQ9D300 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms