Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim42Q9D2H5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim42Q9D2H5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim42Q9D2H5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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