Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Creb3l4Q9D2A5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Creb3l4Q9D2A5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Creb3l4Q9D2A5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms