Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc6bQ9D289 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc6bQ9D289 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms