Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec13Q9D1M0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec13Q9D1M0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec13Q9D1M0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms