Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Lmbr1lQ9D1E5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmbr1lQ9D1E5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms