Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mrpl28Q9D1B9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl28Q9D1B9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms