Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Susd3Q9D176 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Susd3Q9D176 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Susd3Q9D176 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Susd3Q9D176 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms