Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18l2Q9D174 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms