Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd1Q9D0E3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lysmd1Q9D0E3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lysmd1Q9D0E3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lysmd1Q9D0E3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms