Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spc24Q9D083 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spc24Q9D083 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spc24Q9D083 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spc24Q9D083 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spc24Q9D083 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spc24Q9D083 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spc24Q9D083 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms