Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChtopQ9CY57 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChtopQ9CY57 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChtopQ9CY57 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms