Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bud23Q9CY21 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Bud23Q9CY21 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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